Foto: Hradecky et al, 2001. Vista del Momotombito desde el Volcán Momotombo.

La primera actividad volcánica en este sitio ocurrió cuando se originó el antiguo volcán Momotombo, posiblemente un poco antes. El origen del centro volcánico de Momotombito está relacionado con la línea tectónica de la dirección NO-SE, con que se asocian también los volcanes Cerro Montoso y Momotombo. En la construcción de Momotombito participan flujos lávicos de composición basáltica. La estructura de la roca es porfídica con matriz de la estructura hemicristalina. Los fenocristales son representados por plagioclaso básico y piroxeno monoclino. La matriz contiene plagioclas, piroxenos, un mineral metálico y vidrio volcánico. En la orilla, en la parte sursuroeste de la isla, existe un cono de escoria de composición basáltica, que pertenece probablemente a una de las etapas más jóvenes del desarollo del volcán. En las arenas de la playa ubicada en la orilla suroeste hay abundantes fragmentos de la cerámica precolombina.